“不同基因ID类型如何一键转换?”

Connor 火币网官网 2022-11-09 163 0

进行富集分析,使用OmicShare Tools中使用量最最高的富集分析工具固然方便币奥

但是如果手头上的信息不是Ensembl id,又没有相关信息可以快速整理成背景文件,就需要对基因id类型进行转换了币奥

经常有用户咨询小奥币奥,“我的基因类型是这样的(如下图),应该怎么进行转换?”

如果是拟南芥、牛、山羊、秀丽线虫、果蝇、斑马鱼、鸡、人、猕猴、小鼠、籼稻、水稻、大鼠、酵母、番茄、猪、小麦、玉米这18种常见物种的Gene stable ID/Gene name/NCBI gene ID/Gene_Synonym这四种ID类型,可以直接使用OmicShare Tools的基因ID转换工具进行转换币奥

以智人的基因ID为例:

想对gene name转换成Ensembl ID等其他ID类型币奥,只需要上传提交gene name的文件,即可得到相关结果,便于进行后续分析,操作起来非常丝滑!

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关于基因ID转换工具的操作、以及常见问题币奥,在之前的文章中已经非常详细的叙述了,大家可以按照推文一步步进行实操

《摊牌了币奥!一步到位转换 ‍ 基因id转换、get注释信息! 》

如果不是上述的物种或基因类型币奥,该怎么转换呢?

我们在之前的推文中也有分享其他的基因ID转换的工具币奥,植物、真菌、原生动物、后生动物、细菌数据库都有:

《推荐一款好用的基因ID转换工具 》

《推荐一款好用的基因ID转换工具(二) 》

如何使用基因ID转换工具呢币奥

工具链接:

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普通用户可以通过奥币使用工具;

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